MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Methanotorris igneus Kol 5 chromosome

Total Repeats: 9613

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
9501	NC_015562	ATTT	2	8	1828826	1828833	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
9502	NC_015562	ATAA	2	8	1828875	1828882	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
9503	NC_015562	CCCAA	2	10	1829295	1829304	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
9504	NC_015562	A	7	7	1829362	1829368	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9505	NC_015562	A	6	6	1829370	1829375	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9506	NC_015562	AT	3	6	1830758	1830763	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9507	NC_015562	TA	3	6	1830821	1830826	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9508	NC_015562	A	6	6	1830831	1830836	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9509	NC_015562	TAA	2	6	1830838	1830843	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9510	NC_015562	TAA	2	6	1830900	1830905	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9511	NC_015562	AT	4	8	1830948	1830955	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9512	NC_015562	AATT	2	8	1830991	1830998	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9513	NC_015562	A	6	6	1831017	1831022	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9514	NC_015562	AGA	2	6	1831953	1831958	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9515	NC_015562	ATCCT	2	10	1831969	1831978	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
9516	NC_015562	A	6	6	1832025	1832030	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9517	NC_015562	AATT	2	8	1832034	1832041	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9518	NC_015562	T	6	6	1832067	1832072	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9519	NC_015562	ATG	2	6	1832828	1832833	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9520	NC_015562	TTA	2	6	1832834	1832839	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9521	NC_015562	AAAT	2	8	1832841	1832848	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
9522	NC_015562	AT	3	6	1832884	1832889	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9523	NC_015562	TGG	2	6	1832918	1832923	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
9524	NC_015562	T	6	6	1834357	1834362	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9525	NC_015562	AAT	2	6	1834381	1834386	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9526	NC_015562	CAT	2	6	1836330	1836335	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9527	NC_015562	ATA	2	6	1836367	1836372	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9528	NC_015562	GTTA	2	8	1836403	1836410	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
9529	NC_015562	TTG	2	6	1836412	1836417	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9530	NC_015562	TTTA	2	8	1836485	1836492	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
9531	NC_015562	AGT	2	6	1836517	1836522	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9532	NC_015562	ACA	2	6	1836535	1836540	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9533	NC_015562	CA	3	6	1836557	1836562	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
9534	NC_015562	TCAC	2	8	1836563	1836570	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
9535	NC_015562	ATT	2	6	1836593	1836598	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9536	NC_015562	AAAT	2	8	1836600	1836607	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
9537	NC_015562	AATT	2	8	1836652	1836659	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9538	NC_015562	ACC	2	6	1837967	1837972	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
9539	NC_015562	C	6	6	1837971	1837976	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
9540	NC_015562	CAA	2	6	1838025	1838030	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9541	NC_015562	CTC	2	6	1838046	1838051	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
9542	NC_015562	TAT	3	9	1838063	1838071	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9543	NC_015562	TAA	2	6	1838073	1838078	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9544	NC_015562	TAT	2	6	1838079	1838084	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9545	NC_015562	TAT	2	6	1838163	1838168	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9546	NC_015562	A	6	6	1838184	1838189	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9547	NC_015562	TATT	2	8	1838249	1838256	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
9548	NC_015562	GTT	2	6	1838336	1838341	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9549	NC_015562	AAC	2	6	1838443	1838448	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9550	NC_015562	CCA	2	6	1839095	1839100	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
9551	NC_015562	TTG	2	6	1839118	1839123	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9552	NC_015562	T	6	6	1839910	1839915	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9553	NC_015562	TCA	2	6	1839936	1839941	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9554	NC_015562	AT	3	6	1839992	1839997	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9555	NC_015562	TAT	2	6	1840023	1840028	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9556	NC_015562	GAT	2	6	1840043	1840048	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9557	NC_015562	ATT	2	6	1840053	1840058	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9558	NC_015562	TAA	2	6	1840138	1840143	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9559	NC_015562	AAT	2	6	1840262	1840267	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9560	NC_015562	CAT	2	6	1840372	1840377	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9561	NC_015562	GCT	2	6	1840897	1840902	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9562	NC_015562	GCTTC	2	10	1840907	1840916	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
9563	NC_015562	AAT	3	9	1840980	1840988	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9564	NC_015562	TAA	2	6	1841013	1841018	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9565	NC_015562	TAA	2	6	1841067	1841072	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9566	NC_015562	CA	3	6	1841076	1841081	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
9567	NC_015562	AAAAT	2	10	1841106	1841115	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
9568	NC_015562	TC	3	6	1841898	1841903	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
9569	NC_015562	A	7	7	1841916	1841922	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9570	NC_015562	ACC	2	6	1842823	1842828	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
9571	NC_015562	ACT	2	6	1842835	1842840	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9572	NC_015562	AGTT	2	8	1844125	1844132	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
9573	NC_015562	TGA	2	6	1844222	1844227	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9574	NC_015562	TTC	2	6	1844234	1844239	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9575	NC_015562	CTT	2	6	1844252	1844257	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9576	NC_015562	GT	3	6	1844283	1844288	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
9577	NC_015562	AAAAT	2	10	1845473	1845482	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
9578	NC_015562	TA	3	6	1845510	1845515	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9579	NC_015562	TAT	2	6	1845589	1845594	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9580	NC_015562	TAA	3	9	1845597	1845605	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9581	NC_015562	A	6	6	1845621	1845626	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9582	NC_015562	A	6	6	1845632	1845637	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9583	NC_015562	TTA	2	6	1845699	1845704	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9584	NC_015562	A	7	7	1845712	1845718	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9585	NC_015562	T	6	6	1845722	1845727	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9586	NC_015562	T	6	6	1845739	1845744	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9587	NC_015562	GAT	3	9	1845758	1845766	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9588	NC_015562	ATG	2	6	1845785	1845790	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9589	NC_015562	ATAA	2	8	1846763	1846770	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
9590	NC_015562	TA	3	6	1846780	1846785	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9591	NC_015562	T	7	7	1846801	1846807	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9592	NC_015562	TGA	2	6	1846825	1846830	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9593	NC_015562	TAA	2	6	1846848	1846853	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9594	NC_015562	ATT	2	6	1846888	1846893	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9595	NC_015562	T	6	6	1849498	1849503	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9596	NC_015562	T	7	7	1849520	1849526	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9597	NC_015562	TTAT	2	8	1850884	1850891	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
9598	NC_015562	AAT	2	6	1850909	1850914	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9599	NC_015562	TCAT	2	8	1850920	1850927	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
9600	NC_015562	TGAT	2	8	1851064	1851071	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
9601	NC_015562	A	6	6	1851111	1851116	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9602	NC_015562	TG	3	6	1851684	1851689	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
9603	NC_015562	TAA	2	6	1851710	1851715	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9604	NC_015562	TTAT	2	8	1851731	1851738	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
9605	NC_015562	TATGAT	2	12	1851767	1851778	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
9606	NC_015562	TTC	2	6	1851800	1851805	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9607	NC_015562	ATC	2	6	1851879	1851884	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9608	NC_015562	AT	3	6	1851885	1851890	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9609	NC_015562	ATC	3	9	1851905	1851913	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9610	NC_015562	T	6	6	1852953	1852958	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9611	NC_015562	TAT	2	6	1853531	1853536	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9612	NC_015562	TAT	2	6	1854168	1854173	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9613	NC_015562	A	6	6	1854192	1854197	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding

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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.